这种“雇佣军模式”带来的直接副作用是：项目选择方向的失衡和错位。站在科研单位角度，其对主要领域的发展方向和路线选择缺乏决定权，自身也没有足够资源布局。“有时单位想上的项目没有被批准，不太想上的反而被批准了，感觉项目能否被批准有相当大的随机性，所以干脆就把所有想做的、不想做的，着急的、不着急的项目都一口气报上去，看哪个能中。这就是为什么基础研究多年来的经费使用效益低下，因为选题并不是最好的，只能出小成果，出不了真正有价值的成果。”前述基础研究所所长说。

zhezhong“zajiao”dailaidezuizhijiehouguojiushiliangzhongxitongbujianrong，qieyouyushejidicengchongtu，jiejueqilaihenkunnan，jinyibuzaochenggongqiyanwu、chengbenzengjia、kaitonghouguzhangbuduandengyixiliewenti。这(zhe)种(zhong)“(“)杂(za)交(jiao)”(”)带(dai)来(lai)的(de)最(zui)直(zhi)接(jie)后(hou)果(guo)就(jiu)是(shi)两(liang)种(zhong)系(xi)统(tong)不(bu)兼(jian)容(rong)，(，)且(qie)由(you)于(yu)涉(she)及(ji)底(di)层(ceng)冲(chong)突(tu)，(，)解(jie)决(jue)起(qi)来(lai)很(hen)困(kun)难(nan)，(，)进(jin)一(yi)步(bu)造(zao)成(cheng)工(gong)期(qi)延(yan)误(wu)、(、)成(cheng)本(ben)增(zeng)加(jia)、(、)开(kai)通(tong)后(hou)故(gu)障(zhang)不(bu)断(duan)等(deng)一(yi)系(xi)列(lie)问(wen)题(ti)。(。)